Слово стаж употребляется по отношению к лицу, а не к организации. Рекомендуем заменить это слово.
Слово Альянс пишется с прописной буквы, если это слово употребляется вместо полного наименования соответствующей организации.
Как правило, в официальных составных названиях учреждений и организаций с прописной буквы пишется первое слово.
Если это не часть официального названия организации, следует писать оба слова с маленькой буквы: адвокатское бюро.
Речь идет о трех разных организациях, поэтому рекомендуем писать: ООО "ЖКС № 1", "ЖКС № 2", "ЖКС № 3".
Названия должностей и обязанности сотрудников указываются в штатном расписании организации. В нем и нужно искать отличия.
Номенклатуру дел можно определить как систематизированный, оформленный специально установленным образом список дел, которые ведутся в организации.
Приведенные слова нужно писать с прописной буквы, если они употребляются в тексте как индивидуальные названия организаций.
Да, если компания так называется, кавычки нужны: компания «Системный оператор». Условные названия организаций заключаются в кавычки.