Верно: боится темноты.
Да, в этом случае пишется тире с пробелами.
Корректная пунктуация: Если вы думаете о чем-то параллельно с повторением молитвы, то получается какофония: на грубом уровне молитва, а на тонком совсем другое – какие-то образы, рассуждения.
Склоняется только мужская фамилия. В дательном падеже возможно: Воробью и Воробею. Предпочтительно склонять без выпадения гласного (т. е. Воробею), поскольку фамилии выполняют в том числе юридическую функцию.
Если контекст предполагает родительный падеж (например: Состоялась продажа 58/341 долей), то корректно.
Это форма родительного падежа. Для того чтобы в этом убедиться, можно заменить слово волк на неодушевленное существительное, например: Заяц боится смерти. Здесь слово смерть точно стоит в родительном падеже, поскольку у неодушевленных существительных эта форма не совпадает с формой винительного падежа.
В формах ед. ч. именительного падежа окончание нулевое.