По правилам в наименованиях с большой буквы пишется первое слово и входящие в состав названия имена собственные. Правильно: корабль «Черная жемчужина», шхуна «Полярная звезда».
Если оба простых предложения в составе сложносочиненного являются восклицательными, запятая перед союзом и не ставится. Если же первая часть предложения произносится не с восклицательной интонацией, запятую надо поставить: Корабль остался без топлива, и вдобавок на меня напали!
Правильно: много судов. Форма суден — это форма родительного множественного слова судно в значении ‘сосуд’.
Возможна постановка запятой, если требуется подчеркнуть, что "к носу корабля" - это уточнение.
Да, название теплохода заключается в кавычки.
Верно: в зараженной акватории. Вариант с предлогом на, возможно, свойствен профессиональной речи.
Слово космос пишется со строчной буквы.
Корректно: Непривычному человеку покажется, что случилось какое-нибудь бедствие и корабль сейчас пойдёт на дно. Союз и соединяет однородные придаточные части, которые зависят от глагола покажется.
Действительно, в русском языке такой слогораздел невозможен, поскольку сонорный Л не может быть основой слога.