Да, приложение учителю физики школы № 5 выделяется запятыми: Благодарность Ивановой Марии Алексеевне, учителю физики школы № 5, за выступление на семинаре.
Слова по своему обыкновению обособляются: Мария Захарова, по своему обыкновению, за словом в карман не полезла.
Багульник горит, березка стоит голая. Во втором случае имеем составное именное сказуемое с так называемой знаменательной связкой.
Псевдоним, заканчивающийся на -а, склоняется (Р. п. — Мии Бойки).
Верно: рассказал. Подробности - в "Письмовнике".
Вы написали правильно. В письменной деловой речи принята норма согласования с названием должности – директор (безотносительно к полу).
Может быть, мученицы Марии?
Это база данных, для доступа к которой не требуется интернет. Например, сохраненная на компьютере.
Да, именно так.