Для принятия верного решения в таких случаях нужно обращаться к правоустанавливающим документам. В соответствии с ними корректно с прописной: Департамент ветеринарии Минсельхоза России.
Это сложное предложение, вторая часть которого неполная. Обычно в таких случаях на месте пропуска ставится тире, однако при отсутствии паузы знак не нужен.
Тире нужно. О таких предложениях см. параграф 17 полного академического справочника «Правила русской орфографии и пунктуации» под ред. В. В. Лопатина.
Обязательным восклицательный знак здесь не является. Однако поздравление обычно эмоционально окрашено и интонационно выделено, поэтому восклицательный знак, как правило, в таких случаях ставится.
Слово сутки не сочетается с числительными два, три, четыре в именительном падеже. Чтобы выйти из затруднительной ситуации, можно в таких случаях использовать слово день.
Само понятие "действующие правила русского языка" некорректно, таких правил просто нет в природе. Есть свод правил русского правописания, есть нормативные (академические) словари и грамматики.
На портале есть информация и о раздельном написании и так. Один из таких случаев — Ваш. Он хорошо представлен в орфографическом и толковом словарях.
В основу не включаются никакие формообразующие суффиксы. О таких суффиксах можно прочитать в учебнике Е. И. Литневской «Русский язык: краткий теоретический курс для школьников».
Пунктуационно корректно: Для того чтобы у пользователя появился доступ к АРМ ССД, необходимо, чтобы... Обратите внимание на повтор слова чтобы. Лучше таких повторов избегать.
В Вашем предложении сказуемое-существительное задача предшествует подлежащему-инфинитиву отправить. В таких конструкциях пунктуация вариативна: тире ставится при желании автора интонационно разделить предложение на две части.