В словосочетаниях такого типа знаки препинания не требуются.
Корректно: о краже.
Корректно: репетитор по английскому и немецкому языку.
Правилен второй вариант: …одна из причин, по которым…
Верно: заместитель директора предприятия по персоналу.
Сочетания типа по теореме X являются скорее обстоятельством причины (≈ «поскольку такова теорема Х»), нежели ссылкой на источник информации; теорема может быть приведена в разных источниках, созданных разными авторами. Конструкции вроде по словам учёных или по расчётам кого-то заключают в себе субъективность, то есть высказывание основано на мнении, данных или расчётах, которые могут быть подвержены изменению интерпретации или оценке. Такая субъективность характерна для вводных конструкций.
При этом сочетания типа по теореме Х могут быть выделены запятыми, как и любые другие обстоятельства, для попутного пояснения или смыслового выделения.
Правильно: всего два дня, всего несколько дней.
Запятая не ставится.
Оборот не выделяется.
Обособление не требуется.
