Это выражение не обособляется в значении "фактически" и обособляется как вводное в значении "правда, действительно". Решение о постановке знаков препинания нужно принимать исходя из контекста.
В принципе можно писать без кавычек. Возможны варианты, обусловленные замыслом автора.
Это обстоятельство меры и степени (сколь величавые?).
На практике в подобных случаях запятые чаще всего не ставятся, хотя слова на самом деле могут обособляться как вводные.
В чем - союзное слово и часть сказуемого; в чем дело - сказуемое.
Корректно: возбудить уголовное дело в отношении кого-либо. Предлог на сочетается в схожем значении с глаголом завести (завести уголовное дело на кого-либо), но в юридическом языке употребляется только глагол возбудить.
Тире не требуется, в остальном пунктуация верна.
