Реальное (не условное) собственное название Яндекс при употреблении без родового имени в кавычки не заключается: доставка курьером Яндекса, поиск Яндекса даёт другой результат, откройте в Яндексе калькулятор, страницы в Яндекс-браузере.
Имя голосового помощника Алиса на практике пишется без кавычек, что вполне объяснимо: оно воспринимается не как условное название программы, а как имя собственное в узком смысле этого слова (имя человека, персонажа). Корректно: голосовой помощник Алиса, колонка с Алисой и т. д.
Название этой компании надо склонять. Работает в Яндекс – это как живет в Москва.
Если директор — женщина Алиса Иванова, то верно: в лице директора Алисы Ивановой.
Правильно с кавычками: поисковая система "Яндекс".
Употребление пока не устоялось, можно найти доводы в пользу обоих вариантов.
В строгой литературной речи предпочтительнее использовать первый вариант: по данным портала (сервиса) «Яндекс.Пробки». Второй вариант является новым, поэтому его употребление еще не устоялось. В разговорной речи допустимо сочетание по данным «Яндекс.Пробок».
Запятая обязательна: Здравствуйте, Алина!