Корректно: пользоваться будильником на телефоне, скачать музыку на телефон, читать книги на телефоне (или с телефона). Предлоги в и на в русском языке часто конкурируют, но, как правило, предлог в связан с представлением о замкнутом пространстве. Поэтому во многих случаях возможны варианты: на телефоне (как на платформе, с помощью которой совершаются определенные действия, или на экране, на поверхности) и в телефоне (подчеркивается внутреннее устройство, «начинка» аппарата).
Общеупотребительно выражение спаренный телефон.
В значении "на экране телефона" (в разговорной речи) - на телефоне.
Верно: играть на телефоне, играть во что-то на телефоне.
Такой оборот возможен в разговорной речи.
Запятая после выбери нужна. Она ставится на границе частей сложноподчиненного предложения (между главной и придаточной частью).
Обе фразы правильны.
Правильно: кладу трубку.
Верно написание без кавычек.