См. ответ на вопрос № 265590.

Официальное название, закрепленное в российском законодательстве, — федеральная территория «Сириус». Это изначально условное название — наименование образовательного центра.

См. в учебнике Е. И. Литневской, раздел Словосочетание.

Да, условные названия, написанные кириллицей и выступающие в сочетании с родовым словом, заключаются в кавычки: ООО «Сименс».

См. ответ на вопрос № 265590.

Написание зависит от того, как официально зарегистрировано название центра. В любом случае название следует писать в кавычках.

В полном официальном названии первое слово нужно написать с прописной буквы: Институт медиа, архитектуры и дизайна «Стрелка», Научно-технологический университет «Сириус». В сочетаниях второго типа первое слово воспринимается как родовое, а не как часть названия, поэтому корректно: институт «Стрелка», университет «Сириус».