Пожалуйста – наиболее распространенный и стилистически нейтральный вежливый ответ на благодарность. Не за что – разговорный ответ на благодарность, часто имеющий целью принизить говорящим значимость своей услуги, оказать которую ему якобы не составило никакого труда.
Все запятые на месте, дополнительные не нужны.
Корректно: смета, прилагаемая (приложенная) к договору; смета будет приложена к договору, смета будет прилагаться к договору.