Ударение на окончание в этих словах не переходит. Правильно: пароли, шифры.
Ваш вариант расстановки знаков препинания корректен.
Воспользуйтесь, пожалуйста, «Словарем трудностей».
Пунктуация верна.
Воспользуйтесь, пожалуйста, «Словарем трудностей».
Возможны оба варианта.
Это грамматически неосвоенное заимствование (как и кофе).