Корректно: Евангелие от Марка – самое короткое из всех Евангелий.
Слово евангелие имеет формы множественного числа. См.: Зализняк А. А. Грамматический словарь русского языка. 4-е изд. М., 2003. Например: Ее Высочество раздавала раненым Евангелия и образки, и интересовалась ходом лечения («Русское слово», 1905). Однако эти формы употребляются редко.
Пояснительные члены предложения, присоединяемые союзом или, выделяются запятыми: Добрилово, или Симеоново, Евангелие.