Запятыми выделены придаточные предложения в составе сложноподчиненного. Главное предложение – Предусматривалось также, далее начинается придаточное, внутри которого в свою очередь есть придаточное.
Запятая перед открывающей кавычкой нужна: По версии следствия, новосибирец из мести поджёг парикмахерскую, где работала его жена, «с которой у него в результате конфликта сложились личные неприязненные отношения».