Крректно слитное написание: Готовая рукопись так и осталась неопубликованной, затерявшись на чердаке дома. Неопубликованной – это отглагольное прилагательное.
Внутри этого придаточного предложения запятые не нужны, но само придаточное выделяется (или отделяется) запятыми: ..., одним из которых является подготовка к изданию неопубликованных глав, ...
Следует писать раздельно.