Второй вариант предпочтителен.
Такие сочетания можно образовать.
В этом случае сочетание: две души. Числительное два (две) требует формы единственного числа родительного падежа, поэтому ударение падает на и: две душИ.
Верно: дупло в дубе.
Оба варианта возможны.
Предпочтительно: ваша скромность и чистота души.