Дело в том, что слово меридиональный не было образовано в русском языке от меридиан. Это прилагательное, как и существительное меридиан, было заимствовано, оно восходит к немецкому meridional или французскому méridionale от латинского meridionalis. Таким образом, разные основы с разными гласными (meridianus и meridionalis) были уже в латинском языке.
Меридианный - "относящийся к меридиану". Меридиональный - "направленный с севера на юг, по меридиану".
Правильно: меридиональный. Правописание слов проверяется по орфографическому словарю (можно воспользоваться нашим электронным словарем, набрав мериди*ный).