"Сделать пересадку на другой станции, остановке" - пересесть в другом месте. "Поменять место" - пересесть в другое место.
Кавычки уместны в тексте для неподготовленного читателя, не знакомого с этим термином. Если текст адресован читателю, которому должно быть известно сочетание мягкие навыки, кавычки можно опустить.
Это не тавтология, но плеоназм (лексическая избыточность высказывания), т. к. навык вредным не бывает (тавтология – неоправданное соседство однокоренных слов: следует отметить следующие особенности текста).
Здесь верно: НИ.
Правильно: прокачанные (от прокачать).
Запятая нужна, т. к. союз а соединяет однородные члены может мотивировать и может породить, он не включается в вводную конструкцию (его можно опустить без нарушения структуры предложения).
Правильно: коррекция нарушения навыков чтения и письма.