Да, именно с такой пометой — грубое — это слово и дано в словарях.
Допустимо написание Великая теорема Ферма и Малая теорема Ферма с прописной буквы, поскольку это собственные названия теорем, хотя в специальной литературе малая теорема Ферма чаще всего пишется со строчной буквы. Остальные понятия следует писать со строчной буквы: метод факторизации Ферма, спираль Ферма, точка Ферма, числа Ферма.
Факультативно.
Правильно: мини-ферма, но мини молочная ферма. По правилам недопустимо слитное или дефисное написание с приставкой или первой частью сложного слова, если вторая часть представляет собой сочетание слов. В этом случае необходимо раздельное написание.
Корректно: страусиная (страусовая) ферма.
По строгой литературной норме слово альпака не склонется, а ударение падает на последний слог (ферма альпака). На практике в разговорной речи слово склоняют, а ударение ставят на второй слог (ферма альпак). Некоторые словари допускают такое употребление в непринужденной речи.
Пунктуация верна. Но тире в данном случае - авторское (интонационное).
Если слова Соня и Лиза не носят уточняющего характера, то запятая перед именами не нужна.
