Первое слово в таких названиях пишется с большой (прописной) буквы.
Правильно без запятой.
Запятая факультативна. Обратите внимание, нужны кавычки: ООО "Артком".
Правильно: Единый государственный экзамен.
Написание Министерство здравоохранения соответствует правилу: с прописной буквы пишется первое слово в официальном названии учреждения, организации, предприятия. Функция прописной буквы – не придать «важность» слову, а маркировать имя собственное.
При вежливом обращении к одному лицу следует писать Вы с прописной (большой) буквы, при обращении к нескольким лицам – со строчной.
Первый вариант плох стилистически (нанизывание падежей), второй - грамматически (неверное управление). Можно предложить такой вариант: для управляемого взаимодействия с клиентами.
