Здесь действует следующее правило.
При двух или нескольких управляющих словах общее зависимое слово допустимо тогда, когда каждое из управляющих слов требует того же падежа и предлога, например: читать и конспектировать книгу; подбирать и готовить кадры.
Наличие общего зависимого слова при различном управлении нарушает стилистическую норму, например: «с помощью и в сотрудничестве с местными организациями» (ср. правильный вариант: с помощью местных организаций и в сотрудничестве с ними).
Поэтому в Вашем случае верно: управление системой и контроль над ней. О предлогах при слове контроль см. в вопросе 277510.
Запятая не ставится.
Запятая перед как нужна.
При сказуемом, требующем конкретизации (оборот имеет значение отождествления или приравнивания), обороты с союзом как не обособляются: Относись к каждой ошибке как к уроку.
Вера, как говорят святые отцы, крепкий жезл и безопасная пристань.
Запятая не ставится.
Без родового слова верно: «Интерфакс» сообщил.
Запятая не ставится.
Запятая нужна.
Запятая ставится перед придаточной частью сложноподчиненного предложения.
