Трудно представить себе необходимость такого пунктуационного оформления. Может быть, стоит просто заключить весь отрывок в одну пару скобок? В любом случае в данной схеме мы не усматриваем оснований для постановки запятой.
На наш взгляд, ошибки нет.
Правильно: в отсутствие веры (т. е. при отсутствии), но: упрекнуть в отсутствии веры.
Например: уровень воды в нижнем течении реки.
Обособление оборота в целях... факультативно.
Запятыми выделяется уточнение.
Фраза очень плоха.
Названия пустынь, выступающие в роли приложения, не склоняются: в пустыне Сахара.
Оба варианта возможны: в Панино и в Панине, но: в селе Панино.
См. также: Как склонять географические названия?
Нам трудно определить, для чего автор использует это слово в данном предложении. Не лишнее ли оно? Скорее всего, это вводное слово.