В обоих случаях следует писать слитно: примеры неустраненных нарушений, примеры нарушений с длительным сроком неустранения.
Запятая не требуется.
Верен второй вариант.
Допустимы оба варианта, но первый, в котором учитывается граница между приставкой и корнем, предпочтителен. Подробнее см. в ответе на вопрос № 294651.
Запятая перед и нужна.
Запятая не нужна.
Приложения, указывающие на спортивное звание и на спортивную специализацию, неоднородны и не требуют разделения запятой: Бронзовый призер Олимпийских игр пловец Олег Синицын заявил о завершении карьеры.
Очевидно, исследуемые препараты представляют собой производные лимонной кислоты. Если так, то необходимо тире: Исследования инновационных препаратов — производных лимонной кислоты.
Сочетание гормона стресса кортизола не требует постановки каких-либо знаков: это сочетание с приложением, следующим за определяемым словом, более узким и конкретным, чем приложение. См. пункт 1а параграфа 112 (раздел «Орфография») «Полного академического справочника» под ред. В. В. Лопатина (М., 2006 и след.).
В подобных контекстах сочетание в конце концов вводное. Обратите внимание, что в первом предложении после подлежащего, выраженного личным местоимением, тире не требуется.
