Правильно раздельно.
Прилагательное капи́тульный, образованное от существительного капи́тул, сохраняет ударение на втором слоге.
В академическом орфографическом словаре, размещенном на ресурсе «Академос» Института русского языка им. В. В. Виноградова РАН, сейчас дана рекомендация писать ограниченна с двумя н только как краткое прилагательное в значении «недостаточно развитый» (она самоуверенна и ограниченна). В остальных случаях форма женского рода краткого причастия и краткого прилагательного ограничена пишется с одной н: Если последовательность монотонна и ограничена, то она сходится.
Верно: в подчинении кому. Но лучше: подразделение подчинено заместителю директора.
Верно: находится на стадии.
Можно использовать двойное подчеркивание: весь деепричастный оборот подчеркнуть как обстоятельство, а обособленное определение в его составе — еще и как определение.
Это сочетание допустимо в разговорной речи.
