Не очень понятно, что Вас смущает. О времени 1 минута 02 секунды говорят вторая минута, о времени с 90-й по 99-ю минуту говорят на девяностых минутах. Годы с 1990-го по 1999-й вполне закономерно называют девяностыми.
Международный стандарт обозначения времени – через двоеточие: 9:00, 21:00.
Для запятой нет оснований.
Вы корректно построили предложение. Местоимение множественного числа, как и глагол-сказуемое во множественном числе, может относиться к оборотам с числительными, оканчивающимися на один. Сравним примеры, приводимые в «Справочнике по правописанию, произношению, литературному редактированию»: Двадцать один ящик с посудой, которые были доставлены на базу, попали туда по ошибке; Все двадцать одна страница переписаны заново.
Лучше написать так: весь январь был снежным или все январские дни были снежными.
Номера телефонов пишутся без кавычек.
Верно: Подлежал аттестации 91 человек.
Фразу нужно перестроить. Возможен такой вариант: Они проверили 51 учреждение, где проживали нелегалы.
Предпочтительна форма единственного числа.
Пробел нужен.