Пробелы нужны. См. ответ на вопрос 311403.
Обособление не требуется.
В сочетании г. Пермь Пермской области зависимые слова Пермской области, грамматически связанные с существительным Пермь, играют при нем роль несогласованного определения, называющего постоянный признак (см. параграф 53 «Полного академического справочника» под ред. В. В. Лопатина и приведенный в нем пример табуретки с золочеными ножками).
Во втором приведенном Вами случае сочетание Пермская область грамматически не связано со словом Пермь, оно несет в себе дополнительную информацию, а потому его уместно оформить как вставку в скобках: г. Пермь (Пермская область).
Верно: прокурору г. Губахи.
Верен первый вариант.
Да, во всех этих случаях нужны пробелы.
Орфографическим правилам соответствует написание со строчной буквы: администрация г. Ростова-на-Дону. Однако в деловой сфере сложилась традиция писать наименования органов исполнительной власти субъектов Российской Федерации так, как в их конституциях или уставах. В уставе Ростова-на-Дону зафиксировано написание Администрация города Ростова-на-Дону.
Правильно: команде лицея № 5 г. Таганрога.
Правильно с пробелом (как во втором варианте).
Склоняются обе части названия этого города: в г. Ленинске-Кузнецком.
