Фамилия Бруяка склоняется (и мужская, и женская). Правила склонения фамилий см. в «Письмовнике».
Обращение "коллеги" обособляется.
Можно написать с маленькой буквы (злодеев-бармалеев).
Запятая перед тире не нужна.
Правильно: От него пахло свежестью, и было ощущение, что его недавно вымыли специальной жидкостью.
Знаки препинания уже расставлены корректно.
Зависит от смысла, который Вы хотите выразить. Если как = 'в качестве', обособление не нужно; если как = 'будто', обособление требуется.
Возможны оба варианта. Запятые нужно поставить, если оборот после окончания расчетного времени обработки имеет пояснительный характер или на нем нужно сделать акцент, выделить его. Во втором случае вместо запятых лучше использовать тире. Однако такой вариант будет неуместен в строгой официальной речи (в инструкции, приказе и под.).
