Верно: И чем же закончилась ваша переписка? Я ответила: «Ничем, ясное дело».
Постановка кавычек не требуется, но лучше написать агент Икс (во избежание прочтения читателем как "агент Ха").
Запятая не нужна, поскольку между однородными придаточными предложениями есть союз и.
Правильно в родительном падеже мн. числа: сидений.
Правильно раздельное написание: двадцать первое сентября. Скорее всего, Вы неправильно поняли учительницу (возможно, она говорила о словах типа двадцатипятитысячный?).
Запятая нужна. Корректно: Главное – помните, что...
Ссылка изменилась: http://www.gramota.ru/book/litnevskaya.php?part4.htm#i7
Корректно: Но Саша не глуп, и, судя по поведению, тот мужчина что-то скрывает.
Запятая ставится.
Запятая не нужна, но, чтобы избежать разночтений, предложение лучше перестроить. Например: при вводе данных учитывается не больше трех цифр после запятой.
