Если говорить о пунктуационном оформлении, то корректен второй вариант.
Корректно: В ответ на письмо В.М. Борисова и принимая во внимание письмо Ю.В. Александрова направляю Вам для подписания договор, скорректированный с учетом замечаний ранее перечисленных лиц.
Запятая после деепричастного оборота не ставится, так как деепричастный оборот выступает в качестве однородного члена предложения с необособленным обстоятельством.
Такое употребление возможно. Толковые словари фиксируют у слова талантливый значение 'выполненный с талантом', которое иллюстрируется примерами талантливое произведение искусства, талантливый спектакль, талантливое выступление, талантливая работа.
Так написать можно.
Это слово не требует обособления, но при этом, как правило, выступает в роли самостоятельного предложения (подобно некоторым частицам).
В переписке следует писать инициалы до фамилии.
Верно: управляющему филиалом.
См. в «Письмовнике».