Запятую следует поставить.
Это предложение по цели высказывания не вопросительное, а побудительное: его грамматическую основу составляет глагольная форма повелительного наклонения подскажите. Соответственно, вопросительный знак в конце этого предложения не нужен.
Верно: с девяноста тысячами жителей.
Сочетание город-побратим, обозначающее статус какого-либо города относительно другого города, является терминологическим, а потому рекомендуем писать его через дефис даже в тех случаях, когда при нем есть зависимые слова: город-побратим Москвы.
Склонение правильно: в городе Горьком.
См. раздел «Горячие вопросы».
Название города нужно согласовывать: в г. Пушкине, план г. Пушкина.
См. «Письмовник».
Здесь значит выступает в роли союза: Если город строится, значит город живёт! Подробнее см. "Справочник по пунктуации".
