Как во втором варианте.
Корректны варианты: перечислен тысяча один рубль и перечислены тысяча один рубль.
Во всех этих случаях можно поставить запятые - обособить уточняющий оборот. Но при отсутствии уточнительной интонации (паузы) запятые не ставятся (это возможно в последнем примере со словом "новый").
Предлог со фонетически закономерен перед словами, начинающимися с сочетаний [с, з, ш, ж + согласная] или с согласной [щ]: со ста, со славой, со звездой, со шкафа, со жгутом, со щами. Поэтому: со зверем, но с зайцем.
Также предлог со употребляется перед формами с начальными сочетаниями [л, ль, р, м] + согласная: со лба, со мной, со льдом, со ртом; также перед сочетаниями [в] + согласная: со вторника, со всеми, со второго.
Корректно: со вступившим.
Запятая не требуется: это обозначение единой денежной суммы.
Запятая не нужна.
Лучше всего написать и прочитать так: три тысячи семьсот рублей.
Предпочтительно: израсходовано пять миллиардов рублей.
После слова итого можно поставить тире, можно не ставить никакого знака.