Корректно: клинико-патолого-анатомическая конференция.
Правильно: 39-й конференции.
См. в «Словаре трудностей».
Да, такое управление (конференция о) возможно.
Правильно: участвовать в конференции.
Да, правильно.
Если идет речь о конференции, которая была организована в прошлом (а не организуется сейчас), следует использовать причастие прошедшего времени: организованная.
Правильно: XII Международная конференция.
Слово Всероссийский пишется с прописной буквы как первое слово названий организаций, обществ, мероприятий и т. п.: Всероссийский выставочный центр, Всероссийская государственная телевизионная и радиовещательная компания, Всероссийская конференция «Шаг в будущее». Во множественном числе верно написание со строчной: участвовали во всероссийских конференциях.