Может быть, "генеральной директрисы"? :)
Если говорить о названии должности безотносительно к полу лица, эту должность занимающего, то верно: помощник заместителя генерального директора.
Если нужно подчеркнуть, что помощник - женского пола, то корректно: помощница заместителя генерального директора.
А вот пол заместителя и директора в данном случае уточнять не обязательно.
В подобных случаях (они часто свойственны обиходно-разговорной речи) опорное неодушевленное существительное предопределяет форму прилагательного: получить / послать голосовое.
Нет, запятая не нужна.
Запятая нужна только в том случае, если определительный оборот употребляется со значением причины (соки – помощники, потому что они приготовлены из натуральных фруктов). В противном случае запятая не нужна.
Правилен второй вариант.