Для постановки запятой нет оснований.
Верно: По состоянию на 27.12.2019 был перенесен 38 361 номер.
Корректно дефисное написание.
Верно дефисное написание.
Верно написание через дефис: ID-номер.
Такое употребление может вызвать недопонимание.
Если контекст предполагает родительный падеж (например: Состоялась продажа 58/341 долей), то корректно.
В слове понять корень с чередованием я/им, ср.: понятый, понятный, понимать, понимание. Исторически по- является приставкой, при более этимологичном подходе к морфемному членению ее выделяют и сегодня, сопоставляя слова понять, понимать и унять, унимать, внять, внимать.
Для корней с чередованием а(я)/им/ем и а(я)/ин в орфографии есть правило. Его можно прочитать, например, в справочнике ресурса «Орфографическое комментирование русского словаря». Там же можно найти множество слов с той же орфограммой.