Запятая перед и нужна.
Если отчество включает русский суффикс (-ович), то компонент оглы не нужен.
Если рассматривать определительный оборот как поясняющий, то корректно с запятыми.
Правильно: в семье Ольги и Александра Захаревич.
Мы благодарим (кого?): благодарим семью Матвеевых, благодарим Екатерину Валерьевну, но выражаем благодарность (кому?): благодарность семье Матвеевых, благодарность Екатерине Валерьевне.
Слова по теперешним временам обычно не выделяются запятыми.
Это предложение содержит речевой штамп, который к тому же некорректно использован.
Правильно: Владивосток, как и семья Ивановых, был вовлечен в это.
Обстоятельственное сочетание в семье потомственных физиков можно считать уточнением обстоятельства в Дубне (уточнение — это переход от более широкого понятия к более узкому); в этом случае логическое ударение будет нести как одно, так и другое обстоятельство. Однако обстоятельство в Дубне само по себе достаточно конкретно, а потому в обязательном уточнении не нуждается. Без запятой логическое ударение будет нести только обстоятельство в семье потомственных физиков.