На Ваш вопрос можно ответить, воспользовавшись «Большим толковым словарем русского языка» под ред. С. А. Кузнецова. В словарной статье сколько находим значение, в котором слово употреблено в Вашем предложении, — I.2, там же указана часть речи, соответствующая данному значению, — I. местоим. нареч. (местоименное наречие).
Правильно: невооруженным глазом.
Выбор варианта зависит от контекста.
Трудно представить себе необходимость такого пунктуационного оформления. Может быть, стоит просто заключить весь отрывок в одну пару скобок? В любом случае в данной схеме мы не усматриваем оснований для постановки запятой.
Академическим орфографическим словарем зафиксированы два варианта написания этого корня: глутама́ты и глютама́ты, глутами́н и глютами́н, глутами́новый и глютами́новый.
В приведенном Вами тексте знаки препинания не нужны.
