Падь - в Сибири и на Дальнем Востоке - глубокая, часто залесенная горная долина. Падь - в Западной Сибири - болото на обширной, пониженной равнине в лесу.
Предположительно, исторически связано с глаголом падать.
Запятая ставится (выделяется вводное слово).
В подобных случаях название института следует писать в кавычках и не склонять: Учреждение Российской академии наук «Институт серпа и молота», директор Учреждения РАН «Институт серпа и молота».
Так как в указанном месте заканчивается деепричастный оборот, запятая перед тире нужна.
См. в "Справочнике по пунктуации".
Правильно: в общем, ср.: вообще.
Слово действительно может обособляться как вводное, а может выступать в роли обстоятельства и не выделяться запятыми. Так что без контекста ответить на Ваш вопрос нельзя.
Слова тем не менее обычно выполняют функцию союза и не обособляются, хотя иногда их выделяют как вводные при соответствующей интонации.
Слово хотя не используется в качестве вводного: А хотя есть.
