Если перед существительным стоит предлог, верно слитное написание этого существительного с не: направляем решение о невыпуске отчета.
Корректно: врио начальника отдела.
Логика здесь несколько иная. Несклоняемое приложение обычно ставится после словосочетаний. Именно поэтому корректно сочетание файловая система NTFS. Но при этом возможно: FTP-протокол.
Верно: Начальник отдела находится в его непосредственном подчинении и подотчетен ему.
Глаголы проводить и производить в значении «осуществлять, выполнять, делать, совершать (какие-л. действия, работу)» синонимичны. Поэтому оба варианта верны.
См. «Горячие вопросы».
Отрицание не с полным причастием пишется слитно: Оставьте незачеркнутым Ваш вариант ответа.
Корректно: заведующий (чем?) теоретическим отделом.
О человеке, награжденном орденом, говорят: кавалер ордена.
