Между подлежащим, выраженным существительным, и сказуемым, выраженным глаголом в неопределенной форме, ставится тире. Поэтому верен второй вариант.
Использование кавычек факультативно.
Следует писать слитно, верен первый вариант.
Правильно: в отделение.
Этот выражение может выступать как фразеологизованный (цельный) оборот.
Сочетание ученый совет пишется строчными. А что такое большой ученый совет?
Да, корректно выделить значит запятыми с двух сторон.
Словари фиксируют написание этих слов без кавычек: вольный каменщик, вольные каменщики.
Если глагол отвечает на вопросы что делать? и что делать?, мягкий знак пишется. Если на другой вопрос -- не пишется. Правильно: что сделать? -- показаться.
См. в учебнике С. Г. Бархударова «Правила русской орфографии и пунктуации» на портале.