1)
...подрядчиком "Роснефти" стала компания...
или
...подрядчиком "Роснефть" стала компания...
2) ... в дочерних организациях "Росатома"...
или
... в дочерних организациях "Росатом"...
Отсутствие родового слова важно.
Можете сослаться на какое-нибудь официальное правило?
Если нет родового слова, такие названия нужно склонять как обычные существительные.
Последние ответы справочной службы
В этом предложении предпочтителен восклицательный знак, но и точка ошибкой не будет.
Страница ответаВ этом предложении следует использовать частицу не — первую часть противительного союза не... а.
Страница ответаДа, это верное объяснение.
Страница ответа