Шарашкина контора (прост. пренебр.) - несолидное, не вызывающее доверия учреждение, предприятие, организация. Притяжательное прилагательное шарашкина объясняется диалектным шарань «шваль, голытьба, жулье». Шарашкина контора буквально - «учреждение, организация жуликов, обманщиков». Из оборота, в свою очередь, образовано слово шарага «подозрительное место или группа людей».

...Шарашкина контора...

...Шарашкина контора (прост. пренебр.) - несолидное...

§ 25. Буква э пишется после букв ж, ч, ш, ц только в следующих особых случаях. В аббревиатурах, напр.: ЖЭК (жилищно-эксплуатационная контора), ЖЭС (железнодорожная электростанция), ЧЭЗ (частотное электромагнитное зондирование), ЦЭЛТ (цветная электронно-лучевая трубка), ЦЭМ (Центроэлектромонтаж — название треста). После приставки -меж, первых частей сложных и сложносокращенных слов в начале корней, начинающихся с буквы э, напр.

...Буква э после шипящих и ц...

...§ 25. Буква э пишется после букв ж, ч, ш, ц...