Лучше: потеряно, это стилистически нейтральный вариант. Утеряно – канцелярское слово.
Верно: утеряны документы Иванова; утеряны документы на имя Иванова.
Правильно: Утерянный паспорт, выданный УВД города Ноябрьска Ямало-Ненецкого автономного округа Тюменской области.
Допустимо: ни одно письмо и ни одного письма.
Кавычки не нужны, если речь идет о пригородном электропоезде.
1, 3. См. «Письмовник», раздел «Какой падеж нужен при отрицании?».
2. Оба варианта верны. Слово микроб может употребляться и как одушевленное, и как неодушевленное существительное. Подробнее см. в «Письмовнике», раздел «Изучать микробов или микробы? Одушевленность существительных».