Склоняется. Подробно см. в Письмовнике.
Используются все три варианта.
Запятая нужна.
См. «Правила русской орфографии и пунктуации»., параграф 99
Возможные варианты: в четырех из пяти субъектов и в четырех субъектах из пяти.
Верно: более пяти с половиной тонн.