Словоформа – это данное слово в данной грамматической форме. У существительного 12 словоформ (6 падежных форм единственного числа: стационар, стационара... и 6 форм множественного числа: стационары, стационаров...). Стационарно – это не словоформа существительного стационар, это другое слово.
Запятая после оборота несмотря на разъяснения нужна.
Если зависимых слов нет, то следует писать слитно: неперепрофилированные стационары.