Правильно: в селе Молчаново. Без родового слова: в Молчанове (предпочтительно) и в Молчаново (допустимо).
Как правило, в подобных случаях название не склоняется: в селе Боготол.
Предпочтительно: в селе Изобильном.
В селе = в сельском населенном пункте. На селе = вообще в сельской местности.
Корректно: в селе Советском.
См. в «Письмовнике»: Как склонять географические названия?
Верно: в селе Лозном.
См. «Азбучные истины».