Правильно: Машины руки.
Да, можно.
Мыть руки с мылом = мыть руки водой с использованием дополнительно мыла. Мыть руки спиртом = мыть руки только спиртом (без воды).
Запятая ставится.
Полагаем, что правильность того или иного варианта в данном случае может определяться только традицией. Насколько нам известно, традиционна форма в Мыту (ср. в быту, но в Новом Быте [поселок Новый Быт]).
Правилен первый вариант.
Трудно дать однозначный ответ, не зная контекста. Если это прозвище доктора, которое функционирует как имя (в том числе, например, имя персонажа художественного произведения), правильно писать оба слова с прописных, например: «Вот и всё», — сказал Умелые Руки, закончив перевязку. Если же речь о том, что доктор умелец, корректно строчными, например: Василий у нас доктор «умелые руки», советую к нему обратиться. Ср. также: доктор у нас умелые руки.