Слово персонаж в единственном числе склоняется как неодушевленное существительное (ввести комический персонаж). Во множественном числе закономерность такая: при употреблении в знач. «действующие лица» это слово ведет себя как неодушевленное существительное (т. е. винительный падеж совпадает с именительным: ввести новые персонажи), но в знач. «люди» персонаж употребляется как одушевленное существительное (т. е. винительный падеж совпадает с родительным: Чичиков напоминает реальных персонажей).

Прототип – неодушевленное существительное в знач. «первоначальный образец, прообраз чего-л.»: вижу прототип нового оружия. В знач. «лицо, послужившее автору оригиналом для создания литературного образа» прототип может употребляться как одушевленное существительное.

Правильно только типовой во всех значениях.

Варианты равноправны.

Стоянка поезда – одна минута. Согласно протоколу, решению, расписанию.

В большинстве текстов (кроме международных актов) используется строчная буква.

Форма именительного падежа мн. числа – протоколы.

Сложные слова с первым словом бизнес- пишутся через дефис: бизнес-протокол, бизнес-ассистент.

Расстановка знаков препинания верна.