Большой толковый словарь
Правильно: навевает мысли (но: наводит на мысли).
Судя по данным Национального корпуса русского языка, оба сочетания возможны, но сочетание глубина мыслей встречается гораздо реже, а в современных текстах примеры его употребления и вовсе единичны. Глубина мысли предпочтительней.
В приведенном оформлении предложение он не сможет уйти прочитывается исключительно как вставная конструкция, очевидным образом не передающая нужного смысла. Целесообразно было бы использовать здесь косвенную речь: Мысль, что он не сможет уйти, была ясной и четкой.
Верно: донести до читателя.
Материализоваться – двувидовой глагол: он употребляется и как глагол несовершенного вида, и как глагол совершенного вида. Правильно: мысли имеют свойство материализоваться.
Тире ставится несмотря на наличие между подлежащим и сказуемым вводных слов. Рекомендации по постановке знаков есть во всех современных справочниках по правописанию.
Запятая нужна: Вы что, мысли читаете?
Причастный оборот, стоящий после определяемого слова, выделяется запятыми.