После ц в окончаниях и суффиксах под ударением пишется о, без ударения – е. В слове праотец ударение сохраняется на первом слоге во всех формах, в безударном окончании пишется поэтому е.
Ударение во всех формах падает на первый слог: праотец, праотца, праотцу и т. д.; праотцы, праотцев, праотцам и т. д.