В этом предложении нет оснований для использования формы множественного числа. Верно: Амнистирован 7821 гражданин, отбывавший наказание в...
Оба варианта правильны.
Название нужно писать так, как оно записано в уставных документах.
Корректно: система наказаний в российском уголовном праве.
Здесь нужен только один знак – точка в конце предложения.
Корректно: в размере двух тысяч рублей.